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        蒂科生物2018春季血清* WB標(biāo)準(zhǔn)protocol

        2018-03-21 瀏覽次數(shù):1351

        蒂科生物2018春季血清*  WB標(biāo)準(zhǔn)protocol

        蒂科生物2018春季血清*成功完成Western Blot檢測,必須滿足4個條件:

        1凝膠洗脫:轉(zhuǎn)移期間蛋白質(zhì)必須從凝膠中洗脫出來,如果蛋白質(zhì)還截留在凝膠中,將無法在膜上進(jìn)行分析

        2吸附到膜上:在轉(zhuǎn)移過程中蛋白質(zhì)必須吸附到膜上,如果蛋白不吸附,將無法在膜上進(jìn)行分析

        3處理期間仍截留在膜上:在轉(zhuǎn)移后的處理過程中蛋白質(zhì)必須保持吸附在印跡膜上

        4處理過程中可接近:被吸附的蛋白質(zhì)必須能夠與檢測試劑接觸,如果蛋白質(zhì)被掩蓋則無法檢測

        蒂科生物2018春季血清*,成功進(jìn)行WB檢測,則設(shè)置合適正確的對照是*的,只要正確設(shè)置了這些對照,即可快速和準(zhǔn)確的找到WB的問題所在,并保證實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性和特異性!一般需要設(shè)置的對照如下:

        l  陽性對照:明確表達(dá)檢測蛋白的組織或細(xì)胞,用于檢測抗體的工作效率

        l  陰性對照:明確不表達(dá)檢測蛋白組織或細(xì)胞,用于檢測抗體的特異性

        l  二抗對照:不加一抗,用于檢測二抗的特異性

        l  內(nèi)參對照:檢測標(biāo)本的質(zhì)量和二抗系統(tǒng)

        l  空白對照:不加一抗和二抗;用于檢測膜的性質(zhì)和封閉的效果

        蒂科生物2018春季血清*,WB檢測基本過程

        1、獲取細(xì)胞或組織裂解物

        1)根據(jù)檢測蛋白的位置選擇合適的裂解buffer

        蛋白位置

        推薦buffer

        全細(xì)胞

        NP-40 or RIPA

        胞漿(可溶性蛋白)

        Tris-HCl

        胞漿(骨架結(jié)合蛋白)

        Tris-Triton

        膜蛋白

        NP-40 or RIPA

        核蛋白

        RIPA or 核蛋白提取試劑盒

        線粒體蛋白

        RIPA or 線粒體分離試劑盒

        亦可購買商業(yè)化的蛋白提取試劑盒來保證標(biāo)本制備的質(zhì)量

        2)選擇合適的蛋白酶抑制劑,避免蛋白降解,從而保證檢測的準(zhǔn)確性!

        2、蛋白定量

        常用的蛋白定量方法:Bradford assay,Lowry assay BCA assay。定量后,可根據(jù)情況將標(biāo)本保存在-20°C /-80°C備用,進(jìn)行免疫沉淀(IP)或者直接進(jìn)行電泳分離蛋白

        3、電泳分離蛋白質(zhì)

        蒂科生物2018春季血清*,根據(jù)待測蛋白狀態(tài)確定電泳條件:

        待測蛋白狀態(tài)

        凝膠條件

        上樣buffer

        電泳buffer

        Reduced - Denatured

        還原,變性

        β-巰基乙醇或DTT,含SDS

        SDS

        Reduced - Native

        還原,不變性

        β-巰基乙醇或DTT,不含SDS

        不含SDS

        Oxidized - Denatured

        不還原,變性

        不含β-巰基乙醇或DTT,含SDS

        SDS

        Oxidized - Native

        不還原,不變性

        不含β-巰基乙醇或DTT,不含SDS

        不含SDS

        根據(jù)待測蛋白分子量大小確定凝膠濃度

        蛋白分子量(kDa

        凝膠濃度(%)

        4-40

        20

        12-45

        15

        10-70

        12.5

        15-100

        10

        25-200

        8

        4、轉(zhuǎn)膜

        根據(jù)不同的檢測目的和待測蛋白的特性,選擇合適的膜類型。常用的轉(zhuǎn)移膜類型有:PVDF膜、硝酸纖維素膜(NC膜)和尼龍膜,其中PVDFNC膜的使用頻率zui高。各種膜的技術(shù)參數(shù)及比較如下:

         

        PVDF

        NC

        尼龍膜

        靈敏度和分辨率

        背景

        較高

        蛋白結(jié)合能力

        100-200ug/cm2(適用于SDS存在時與蛋白結(jié)合)

        80-100ug/cm2

        >400ug/cm2

        機(jī)械強(qiáng)度

        強(qiáng)

        干的膜易脆

        軟而結(jié)實(shí)

        溶劑抗性

        強(qiáng)

        使用前是否需要浸潤

        100%甲醛潤濕

        緩沖液潤濕

        緩沖液潤濕

        適用染色方法

        膠體金、麗春紅、酰胺黑、印度墨汁、考馬斯亮蘭

        膠體金、麗春紅、酰胺黑、印度墨汁

        不能用陰離子染料

        適用檢測方法

        顯色法、化學(xué)發(fā)光、熒光、放射性、化學(xué)熒光、快速免疫檢測

        顯色法、化學(xué)發(fā)光、熒光、放射性

        顯色、化學(xué)發(fā)光、放射性

        適用范圍

        普通蛋白WB、糖蛋白檢測、蛋白質(zhì)測序、氨基酸分析、重復(fù)檢測

        普通蛋白WB、氨基酸分析、重復(fù)檢測。0.1um膜適用于7kDa以下蛋白

        低濃度小分子蛋白、酸性蛋白、糖蛋白、蛋白多糖、核酸檢測常用

        價格

        較低

        5、封閉

        去掉膜上多余的非特異性結(jié)合位點(diǎn),降低背景。常用的封閉溶液有:含BSA或者脫脂奶粉的TBSTTBS

        6、一抗孵育

        一抗的選擇成功與否,是整個WB實(shí)驗(yàn)成功的關(guān)鍵:選擇一抗有以下幾個注意點(diǎn):

        l  選擇適合檢測標(biāo)本種屬的一抗(說明書有驗(yàn)證)

        l  選擇適用于WB實(shí)驗(yàn)方法的一抗(說明書有驗(yàn)證)

        l  選擇單克隆抗體或者經(jīng)過親和純化的多克隆抗體

        一抗的保存和使用:

        l  根據(jù)說明書的要求條件進(jìn)行抗體的保存;一般需要將抗體分裝后放入-20度保存,避免反復(fù)凍融。

        l  抗體的工作液現(xiàn)配現(xiàn)用,在4度保存不要超過2

        l  根據(jù)說明書推薦濃度使用TBST稀釋一抗。由于實(shí)驗(yàn)室條件和檢測方法等的差異,說明書推薦的稀釋比例只作參考,需要在說明書推薦的濃度周邊進(jìn)行多個濃度梯度的實(shí)驗(yàn)檢測,然后選擇信噪比的抗體濃度進(jìn)行實(shí)驗(yàn)。如果說明書沒有推薦濃度,可進(jìn)行多個稀釋比例進(jìn)行摸索*稀釋度(1:100-1:3000)。

        l  孵育條件:推薦4°C孵育過夜(一般大于18個小時),根據(jù)抗體親和力不同孵育時間有所區(qū)別

        7、二抗孵育

        根據(jù)說明書推薦濃度使用TBST稀釋一抗。如果說明書沒有推薦濃度,可進(jìn)行多個稀釋比例進(jìn)行摸索*稀釋度(1:1000-1:20000)。孵育條件一般為室溫1-2小時

        8、底物孵育

        選擇顯色或者化學(xué)發(fā)光底物。一般傾向于化學(xué)發(fā)光,靈敏度高且背景低,節(jié)省抗體用量

        9、結(jié)果分析和檢測

        凝膠成像系統(tǒng)檢測或者暗室曝光到膠片

        Note:從封閉開始,每步之間都需要用TBST進(jìn)行洗滌,3次,每次5min

        蒂科生物2018春季血清*,WB技術(shù)要點(diǎn)和常見問題分析

        WB過程中常見的問題及可能原因分析

        問題

        可能原因

        驗(yàn)證或解決辦法

        轉(zhuǎn)膜不充分

        膜沒有*均勻濕透

        使用100% methanol浸透膜

        靶蛋白分子量小于10,000

        選擇小孔徑的膜,縮短轉(zhuǎn)移時間

        靶蛋白等電點(diǎn)等于或接近轉(zhuǎn)移緩沖液pH

        可嘗試使用其他緩沖液如CAPS緩沖液(pH 10.5)或使用低pH值緩沖液如乙酸緩沖液

        甲醇濃度過高

        過高甲醇濃度會導(dǎo)致蛋白質(zhì)與SDS分離,從而沉淀在凝膠中,同時會使凝膠收縮或變硬,從而抑制高分子量蛋白的轉(zhuǎn)移。降低甲醇濃度或者使用乙醇或異丙醇代替

        轉(zhuǎn)移時間不夠Thick gel

        對于厚的膠以及高分子量蛋白需要延長轉(zhuǎn)移時間

        背景高

        膜沒有*均勻濕透

        使用100% methanol浸透膜

        洗膜不充分

        增加洗液體積和洗滌次數(shù)

        阻斷不充分

        增加封閉液孵育時間,或者提高溫度。選擇合適的封閉試劑(脫脂奶粉,BSA,酪蛋白等)

        二抗?jié)舛冗^高

        降低二抗?jié)舛?/span>

        檢測過程中膜干燥

        保證充分的反應(yīng)液,避免出現(xiàn)干膜現(xiàn)象

        曝光過度

        縮短曝光時間

        抗體與阻斷蛋白有交叉反應(yīng)

        檢測抗體與阻斷蛋白的交叉反應(yīng)性,選擇無交叉反應(yīng)的封閉劑。洗滌液中加入Tween-20可減少交叉反應(yīng)

        沒有陽性條帶

        抗體染色不充分

        增加抗體濃度,延長孵育時間

        酶失活

        直接將酶和底物進(jìn)行混合,如果不顯色則說明酶失活了。選擇在有效期內(nèi)、有活性的酶聯(lián)物

        標(biāo)本中不含靶蛋白或靶蛋白含量太低

        設(shè)置陽性對照,如果陽性對照有結(jié)果,但標(biāo)本沒有則可能是標(biāo)本中不含靶蛋白或靶蛋白含量太低。可考慮增加標(biāo)本上樣量解決靶蛋白含量低的原因。

        試劑不匹配

        一抗與組織種屬,一抗與二抗或/和底物與酶系統(tǒng)之間不匹配。通過設(shè)置內(nèi)參照可以驗(yàn)證二級檢測系統(tǒng)的有效性

        一抗失效

        選擇在有效期內(nèi)抗體;并選擇現(xiàn)配現(xiàn)用的工作液

        HRP抑制劑

        所用溶液和容器中避免含有疊N化Na

        有陽性條帶,但條帶比較弱

        抗體染色不充分

        增加抗體濃度,延長孵育時間

        酶活性降低

        直接將酶和底物進(jìn)行混合,如果不顯色則說明酶失活了。選擇在有效期內(nèi)、有活性的酶聯(lián)物

        標(biāo)本中靶蛋白含量太低

        增加標(biāo)本上樣量。

        洗膜過度

        縮短洗滌時間

        HRP抑制劑

        所用溶液和容器中避免含有疊N化Na

        抗體活性降低

        選擇在有效期內(nèi)的抗體,工作液現(xiàn)配現(xiàn)用,避免長時間放置

        蛋白轉(zhuǎn)移不充分

        見上述

        封閉過度

        減少封閉劑的量或縮短時間;換用不同封閉劑類型

        曝光時間過短

        延長曝光時間

        HRP抑制劑

        所用溶液和容器中避免含有疊N化Na

        條帶位置(大小)不對;或有非特異性條帶

        二抗的非特異性結(jié)合

        增加一個對照:不加一抗,其他操作過程不變,即可驗(yàn)證背景是否由二抗系統(tǒng)來源。選擇其他二抗(特異性更強(qiáng)的,只針對重鏈的)

        一抗的特異性不夠

        使用單克隆或者親和純化的抗體,保證抗體的特異性

        蛋白降解

        使用新鮮制備的標(biāo)本,并使用蛋白酶抑制劑

        二聚體或多聚體存在

        增加蛋白質(zhì)變性過程及強(qiáng)度

        抗體濃度過高

        降低抗體(一抗、二抗)濃度,可以減少非特異性條帶

        蛋白上樣量過大

        降低上樣量

        背景有斑點(diǎn)

        封閉劑中有聚集體

        使用前過濾封閉試劑

        HRP耦聯(lián)二抗中有聚集體

        過濾二抗試劑,去除聚集體

        膜上出現(xiàn)反像(暗背景上白色帶)

        HRP含量過高

        降低酶聯(lián)二抗的濃度

         

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